村鎮污水主要由生活污水和農業廢水組成。生活污水成分比較固定，主要含有碳水化合物、蛋白質、氨基酸、脂肪等有機物，比較適合于細菌的生長，成為細菌、病毒生存繁殖的場所；但生活污水一般不含有毒性，且具有一定的肥效，可用來灌溉農田。農業廢水的成分則多種多樣，不同的季節，不同的地方，不同發展目標的村鎮，其廢水需要用不同的處理方法。在處理污水時，為減小污水排放量及其復雜程度，應結合國家正在大力推廣的沼氣池建設，將生活用水中的沖廁用水(黑水)和其他生活用水(灰水)分開。灰水用自然凈化系統處理，黑水以及人畜糞便經厭氧沼氣池處理，不但可以降低污水的排放量、復雜程度和處理費用，而且對發展農村清潔新能源，保護人居環境、促進農村經濟社會的可持續發展等具有重要的意義。